28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1662 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  66.42 
 
 		 414 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  67.4 
 
 		 410 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  65.11 
 
 		 426 aa  541  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  49.87 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  52.76 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  36.88 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  33.88 
 
 		 413 aa  229  9e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  34.77 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  34.55 
 
 		 421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  34.33 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  34.25 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  32 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  33.42 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  34.25 
 
 		 424 aa  200  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  33.15 
 
 		 486 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  35.41 
 
 		 478 aa  196  9e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  35.14 
 
 		 487 aa  195  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  36.54 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  31.98 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  24.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  24.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  23.66 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  24.78 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0583  O-antigen polymerase  23.47 
 
 		 449 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  25.58 
 
 		 671 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>