21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4438 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  74.74 
 
 		 413 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  73.59 
 
 		 418 aa  591  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  72.79 
 
 		 413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  57.68 
 
 		 420 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  57.71 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  59.28 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  37.33 
 
 		 487 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  37.36 
 
 		 424 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  37.33 
 
 		 478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  37.5 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  36.67 
 
 		 486 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  38.17 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.15 
 
 		 410 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.42 
 
 		 414 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  34.25 
 
 		 408 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  35.54 
 
 		 419 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  33.87 
 
 		 424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  37.37 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  37.65 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  30.2 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>