25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1309 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  97.56 
 
 
410 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
414 aa  822    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  67.87 
 
 
426 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  66.42 
 
 
408 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  49.63 
 
 
424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  53.37 
 
 
421 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  36.97 
 
 
420 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  36.48 
 
 
423 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  34.32 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  35.24 
 
 
421 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  32.92 
 
 
418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  35.2 
 
 
413 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  36.61 
 
 
424 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  35.42 
 
 
414 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  35.05 
 
 
419 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  33.98 
 
 
486 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  34.96 
 
 
487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  34.69 
 
 
478 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  37.74 
 
 
441 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  33.78 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  24.15 
 
 
440 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  24.45 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  25.62 
 
 
474 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
464 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  24 
 
 
404 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>