22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3684 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  100 
 
 
424 aa  844    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  74.45 
 
 
486 aa  557  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  72.75 
 
 
478 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  72.75 
 
 
487 aa  537  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  69.08 
 
 
419 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  67 
 
 
421 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  36 
 
 
426 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.68 
 
 
414 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  36.41 
 
 
410 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  34.02 
 
 
408 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  33.76 
 
 
421 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  35.89 
 
 
423 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  33.6 
 
 
413 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  33.61 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  32.29 
 
 
420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  33.15 
 
 
413 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  34.21 
 
 
414 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  33.6 
 
 
418 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  31.34 
 
 
424 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  37.86 
 
 
441 aa  163  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.36 
 
 
436 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.21 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>