22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1221 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  97.56 
 
 
414 aa  775    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
410 aa  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  68.54 
 
 
426 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  67.4 
 
 
408 aa  559  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  50.13 
 
 
424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  53.08 
 
 
421 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  37.22 
 
 
420 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  37.01 
 
 
423 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  35.24 
 
 
421 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  34.23 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  37.33 
 
 
424 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  32.43 
 
 
418 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  35.15 
 
 
414 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  35.05 
 
 
413 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  35.14 
 
 
419 aa  206  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  35.23 
 
 
487 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  33.43 
 
 
486 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  34.96 
 
 
478 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  37.77 
 
 
441 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  33.88 
 
 
421 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  24.93 
 
 
440 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  24.09 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>