22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1729 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  86.7 
 
 		 478 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  959    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  86.7 
 
 		 487 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  74.45 
 
 		 424 aa  551  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  69.37 
 
 		 419 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  70.3 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  36.34 
 
 		 414 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  34.93 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  37.53 
 
 		 423 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  34.43 
 
 		 418 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  34.77 
 
 		 413 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  35.89 
 
 		 421 aa  216  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  33.16 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  34.34 
 
 		 426 aa  213  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.78 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  34.38 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  33.97 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.24 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  32.29 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  36.76 
 
 		 441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  29.74 
 
 		 671 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  23.33 
 
 		 672 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>