26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1497 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  100 
 
 
672 aa  1316    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  73.66 
 
 
671 aa  921    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  30.27 
 
 
668 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25 
 
 
501 aa  63.9  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.2 
 
 
468 aa  60.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  30.73 
 
 
498 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.56 
 
 
500 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.73 
 
 
594 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.19 
 
 
594 aa  55.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  31.1 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  29.11 
 
 
437 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  28.77 
 
 
496 aa  52  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  25.66 
 
 
454 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  29.3 
 
 
589 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  28.23 
 
 
436 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.86 
 
 
512 aa  48.9  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  28.04 
 
 
456 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  23.63 
 
 
465 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  25.65 
 
 
466 aa  45.8  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  27.68 
 
 
592 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  28.02 
 
 
592 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  28.02 
 
 
592 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  32.61 
 
 
467 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  27.54 
 
 
446 aa  44.7  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  35.71 
 
 
415 aa  44.3  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  31.4 
 
 
503 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>