80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2478 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  100 
 
 		 415 aa  820    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  42.79 
 
 		 435 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  45.76 
 
 		 430 aa  252  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  38.48 
 
 		 422 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  35.84 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  30.72 
 
 		 426 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  27.73 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  27.73 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  31.27 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  29.93 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  27.71 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.13 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  29.39 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  29.05 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.96 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  28.52 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  23.91 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  25.15 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  32.97 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  26.5 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  28.76 
 
 		 418 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  29.84 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  28.78 
 
 		 594 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  33.12 
 
 		 671 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 426 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  28.84 
 
 		 592 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  28.84 
 
 		 592 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  28.84 
 
 		 592 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  30.36 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 426 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  30.22 
 
 		 426 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  30.36 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  23.05 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  30 
 
 		 448 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  31.39 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  27.72 
 
 		 596 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 594 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  24.11 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 427 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 454 aa  50.4  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  30.89 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  30.46 
 
 		 593 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  30.85 
 
 		 595 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  31.37 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  36.28 
 
 		 672 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  31.95 
 
 		 607 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  27.89 
 
 		 592 aa  47.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  32.61 
 
 		 426 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  32.61 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  29.33 
 
 		 579 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  23.79 
 
 		 444 aa  44.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  23.81 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  23.81 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  29.47 
 
 		 592 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  26.92 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1355  O-antigen polymerase  29.52 
 
 		 843 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 754 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 468 aa  43.1  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 435 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  21.51 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 661 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  36.36 
 
 		 472 aa  43.1  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 595 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  28.16 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>