48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0206 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  100 
 
 		 444 aa  892    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  37.23 
 
 		 435 aa  204  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  35.64 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  36.64 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  32.71 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  27.91 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.63 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.63 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  29.33 
 
 		 425 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.69 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  30.1 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  29.07 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  28.3 
 
 		 435 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  21.62 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  29.02 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  22.22 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  30.9 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  29.09 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  25.16 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  30.43 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  32.43 
 
 		 358 aa  50.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 417 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  30 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  28.02 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  28.48 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  24.17 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 443 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  24.75 
 
 		 409 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  27.98 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0799  O-antigen polymerase  32.64 
 
 		 465 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00494175  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  25.58 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 440 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  29.94 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  30.87 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  31.33 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  33.78 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>