18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4372 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  100 
 
 		 427 aa  861    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  34.6 
 
 		 410 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  34.11 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  34.11 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  34.11 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  33.59 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  33.59 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  33.59 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  33.59 
 
 		 417 aa  209  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  34.04 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  24.1 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.05 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.05 
 
 		 408 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  30.33 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  26.27 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  23.85 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>