28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3581 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  100 
 
 		 429 aa  835    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  34.07 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  34.71 
 
 		 426 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  32.16 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  31.43 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  30.38 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  28 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  31.32 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.76 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.76 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  29.91 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  27.96 
 
 		 444 aa  53.9  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  31.82 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  30.69 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  22.35 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  25.99 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 417 aa  43.9  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>