30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2617 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  796    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.32 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  25.94 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  25.94 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  24.92 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.72 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  27.03 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  22.94 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  23.46 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  21.63 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  22.11 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.65 
 
 		 393 aa  53.5  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  22.22 
 
 		 425 aa  53.1  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  27.76 
 
 		 437 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  24.87 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  25.13 
 
 		 443 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  24.31 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 481 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  23.95 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.31 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  30.83 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>