14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2346 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  100 
 
 		 481 aa  958    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1889  O-antigen polymerase  29.51 
 
 		 494 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818952  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  27.44 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2284  O-antigen polymerase  30 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  27.63 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  34.62 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0891  O-antigen polymerase  32.08 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  29.09 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  29.09 
 
 		 408 aa  44.3  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0851  O-antigen polymerase  30.99 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0291  hypothetical protein  29.25 
 
 		 449 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  34.18 
 
 		 313 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>