49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0160 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  100 
 
 		 408 aa  816    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  100 
 
 		 408 aa  816    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  29.33 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  25.3 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  29.95 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25.31 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  30.95 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4374  O-antigen polymerase  32.8 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  27.33 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  25.48 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  30.86 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  28.38 
 
 		 425 aa  67  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  31.03 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3959  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0194478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03430  hypothetical protein  30.51 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0910551  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0087  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0556509  normal  0.17743 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0980  hypothetical protein  29.05 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03479  Lipid A-core, surface polymer ligase  30.51 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.120571  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3833  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000244631  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4049  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0576542  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0861  O-antigen polymerase  29.05 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  28.05 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  27.78 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  26.77 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 434 aa  49.7  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  30.15 
 
 		 426 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  29.73 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 489 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  34.04 
 
 		 492 aa  46.6  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  24.74 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  21.07 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.4 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.4 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  27.83 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  28.24 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  29.09 
 
 		 481 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  23.94 
 
 		 1090 aa  43.1  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>