24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1374 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  100 
 
 		 426 aa  845    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  32.32 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  27.35 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  30 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  24.46 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 440 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  23.18 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  27.74 
 
 		 738 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.36 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  31.75 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  30.1 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  31.37 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  30.71 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  21.84 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  28.83 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  35.37 
 
 		 590 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  30.38 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 438 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  22.6 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  28.04 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  30.49 
 
 		 589 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>