45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0184 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  100 
 
 		 435 aa  868    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  60.42 
 
 		 430 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  41.65 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  42.79 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  37.23 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  26.38 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  26.38 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  31.29 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  29.53 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25.87 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.78 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.95 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  30.81 
 
 		 435 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3581  O-antigen polymerase  28.2 
 
 		 429 aa  53.1  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  31.94 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  30.52 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  30.52 
 
 		 426 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25 
 
 		 579 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  30.05 
 
 		 426 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  30 
 
 		 437 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  29.38 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  22.54 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  29.38 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  30.94 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0780  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.292399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  21.97 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  22.54 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  24.46 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 466 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  22.54 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  22.54 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  22.54 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  35.85 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  30.67 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.66 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.03 
 
 		 496 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  30.67 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4125  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.314741  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  30.95 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4372  O-antigen polymerase  28.24 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>