35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1851 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  874    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  99.3 
 
 
436 aa  870    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.39 
 
 
426 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.39 
 
 
426 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  28.39 
 
 
426 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.64 
 
 
426 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.38 
 
 
398 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  25.42 
 
 
416 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  25.06 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  26.68 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  27 
 
 
426 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  26.5 
 
 
426 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  26.85 
 
 
415 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.82 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  22.53 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  22.71 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  25.5 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.5 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.5 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  24.48 
 
 
405 aa  67  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  22.97 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  25.85 
 
 
418 aa  63.9  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.98 
 
 
426 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  29.24 
 
 
426 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  23.33 
 
 
448 aa  60.1  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  30.41 
 
 
417 aa  54.3  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  30.41 
 
 
407 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  33.05 
 
 
447 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  27.14 
 
 
489 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  32.84 
 
 
425 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  23.56 
 
 
426 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0267  O-antigen polymerase  35.42 
 
 
430 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  25.15 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.19 
 
 
417 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  26.19 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>