54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2053 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  100 
 
 		 405 aa  809    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  63.41 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  31.27 
 
 		 432 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  32.94 
 
 		 426 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  31.61 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  31.61 
 
 		 426 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  31.01 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  30.46 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  30.43 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  25.71 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  25.42 
 
 		 436 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.15 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  27.15 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  32.49 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  27.02 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  26.5 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  28.05 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  32.85 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  25.44 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  22.93 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  34.62 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  24.5 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  29.14 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 579 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  23.46 
 
 		 495 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  20.9 
 
 		 773 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1351  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  23.49 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  21.96 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  29.03 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  26.15 
 
 		 408 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  26.4 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 430 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  21.97 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  25.13 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  25.13 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  28.08 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2617  hypothetical protein  23.5 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  31.58 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  26.8 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 436 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  26.76 
 
 		 829 aa  43.5  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>