35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2801 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  100 
 
 		 434 aa  872    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  58.94 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  51.6 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  46.1 
 
 		 426 aa  335  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.04 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.77 
 
 		 426 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.77 
 
 		 426 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.04 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  27.91 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  26.21 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  26.21 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  22.97 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.83 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  22.73 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  25 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  22.3 
 
 		 398 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 413 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  20.17 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  31.39 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  28.12 
 
 		 426 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  19.15 
 
 		 416 aa  50.4  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 417 aa  50.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.32 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.32 
 
 		 408 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  22.39 
 
 		 431 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  23.62 
 
 		 446 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 754 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0083  O-antigen polymerase  20.83 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0973021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>