23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1355 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1385  O-antigen polymerase  98.22 
 
 
843 aa  1649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3989  O-antigen polymerase  51.72 
 
 
864 aa  721    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000845888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1355  O-antigen polymerase  100 
 
 
843 aa  1677    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1775  hypothetical protein  27.84 
 
 
713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  33.73 
 
 
471 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.98 
 
 
457 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  25.1 
 
 
457 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25 
 
 
501 aa  54.3  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.7 
 
 
461 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  27.75 
 
 
594 aa  52  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.6 
 
 
425 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.8 
 
 
437 aa  50.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.13 
 
 
464 aa  50.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  30.39 
 
 
435 aa  49.3  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
632 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.35 
 
 
737 aa  47.8  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.75 
 
 
594 aa  47.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  28.06 
 
 
438 aa  47.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  25.93 
 
 
436 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
388 aa  46.2  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  29.53 
 
 
467 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  30.56 
 
 
563 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  32.22 
 
 
734 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>