13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3989 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1355  O-antigen polymerase  51.01 
 
 
843 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3989  O-antigen polymerase  100 
 
 
864 aa  1703    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000845888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1385  O-antigen polymerase  50.41 
 
 
843 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1775  hypothetical protein  35.86 
 
 
713 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  32.23 
 
 
436 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  29.17 
 
 
437 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 
626 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 
614 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 
614 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
614 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
614 aa  45.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
614 aa  45.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.36 
 
 
626 aa  45.4  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>