10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1775 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1775  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1390    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3989  O-antigen polymerase  32.08 
 
 		 864 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000845888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1385  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 843 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1355  O-antigen polymerase  24.51 
 
 		 843 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.33 
 
 		 880 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 461 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  28.16 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  31.09 
 
 		 446 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 686 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26080  lipid A core-O-antigen ligase-like enyme  29.91 
 
 		 655 aa  44.3  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>