29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2648 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  827    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  84.09 
 
 		 421 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  69.37 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  69.08 
 
 		 424 aa  494  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  69.72 
 
 		 487 aa  495  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  69.47 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  33.5 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  34.81 
 
 		 426 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.51 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.43 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  35.83 
 
 		 413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  35.01 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  33.51 
 
 		 420 aa  210  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  33.6 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  36.16 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  34.79 
 
 		 421 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  34.37 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  35.05 
 
 		 414 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  32.51 
 
 		 424 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  36.09 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  26.92 
 
 		 671 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 672 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.13 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.13 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.13 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.13 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.13 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  26.6 
 
 		 404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>