23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2467 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  842    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  85.92 
 
 		 420 aa  682    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  69.6 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  59.95 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  59.17 
 
 		 413 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  57.71 
 
 		 414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  56.58 
 
 		 418 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  38.69 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.24 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  35.24 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  34.55 
 
 		 408 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  35.34 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  36.09 
 
 		 486 aa  230  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  36.36 
 
 		 478 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  36.36 
 
 		 487 aa  226  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  39.22 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  36.26 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  33.61 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  35.47 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  35.94 
 
 		 441 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  23.32 
 
 		 440 aa  55.1  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5553  hypothetical protein  25.42 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3730  hypothetical protein  25.42 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>