25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4936 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  84.09 
 
 
419 aa  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  833    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  70.3 
 
 
486 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  69.8 
 
 
478 aa  497  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  70.05 
 
 
487 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  67 
 
 
424 aa  482  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  36.87 
 
 
423 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  35.66 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  34.93 
 
 
413 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  33.6 
 
 
420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  34.17 
 
 
426 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  36.34 
 
 
421 aa  211  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.42 
 
 
414 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  32.12 
 
 
408 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  34.56 
 
 
418 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.25 
 
 
410 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  35 
 
 
414 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  31.99 
 
 
421 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  30.59 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  36.76 
 
 
441 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  23.36 
 
 
404 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  23.36 
 
 
404 aa  46.6  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  23.36 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  23.05 
 
 
404 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.74 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>