23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1116 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1013  hypothetical protein  89.83 
 
 		 413 aa  695    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1116  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5061  hypothetical protein  77.78 
 
 		 418 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4438  hypothetical protein  72.79 
 
 		 414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1411  hypothetical protein  56.97 
 
 		 420 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2467  hypothetical protein  59.05 
 
 		 421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4608  hypothetical protein  58.27 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.547088  normal  0.0662685 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  37.91 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  35.35 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1309  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.91 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1662  hypothetical protein  34.33 
 
 		 408 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1781  hypothetical protein  34.88 
 
 		 487 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.907902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2117  hypothetical protein  33.88 
 
 		 478 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1729  hypothetical protein  34.69 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1221  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.92 
 
 		 410 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2648  hypothetical protein  34.93 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1153  hypothetical protein  36.59 
 
 		 421 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3684  O-antigen polymerase  33.06 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3002  hypothetical protein  35.15 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4936  hypothetical protein  36.08 
 
 		 421 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 612 aa  47.4  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.26 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  22.8 
 
 		 404 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>