14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2436 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  100 
 
 		 894 aa  1768    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  37.78 
 
 		 686 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  37.78 
 
 		 686 aa  54.3  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  42.5 
 
 		 544 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  23.31 
 
 		 579 aa  52  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  47.62 
 
 		 438 aa  48.9  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  29.41 
 
 		 416 aa  48.5  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  47.62 
 
 		 438 aa  48.1  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  28.11 
 
 		 413 aa  47.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  27.45 
 
 		 416 aa  47  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  37.8 
 
 		 467 aa  46.6  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  31.58 
 
 		 474 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  30.17 
 
 		 540 aa  45.1  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 552 aa  44.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>