57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0679 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  100 
 
 		 437 aa  860    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  60.38 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  35.94 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  32.34 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  23.7 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  27.17 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  30.77 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 464 aa  57  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.69 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.69 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.69 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.22 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.69 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  30.22 
 
 		 537 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  30.52 
 
 		 456 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  26.1 
 
 		 436 aa  52.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  29.21 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.48 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 668 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25.95 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  23.53 
 
 		 389 aa  50.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  30.09 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  30.09 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 498 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.21 
 
 		 501 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  29.65 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.24 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  28.89 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  22.36 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 754 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  23.53 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  24.8 
 
 		 444 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  28.19 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  29.93 
 
 		 393 aa  47  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  23.18 
 
 		 340 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0802  O-antigen polymerase  22.97 
 
 		 470 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.38 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  34.78 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  37.29 
 
 		 425 aa  43.5  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 426 aa  43.5  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 531 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 589 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>