27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2523 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  100 
 
 		 738 aa  1489    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  27.76 
 
 		 426 aa  55.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.01 
 
 		 737 aa  55.1  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  23.99 
 
 		 433 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  26.63 
 
 		 829 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.52 
 
 		 773 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.99 
 
 		 509 aa  50.8  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  31.82 
 
 		 434 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  39.77 
 
 		 440 aa  50.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  31.06 
 
 		 434 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  34.82 
 
 		 467 aa  48.5  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  34.45 
 
 		 686 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  34.45 
 
 		 686 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  32.3 
 
 		 785 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  32.17 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.56 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 789 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  22.83 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  33.03 
 
 		 438 aa  46.6  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  29.14 
 
 		 471 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  36.26 
 
 		 442 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  23.82 
 
 		 452 aa  45.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  28.89 
 
 		 419 aa  45.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2284  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 452 aa  44.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 754 aa  44.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  22.51 
 
 		 440 aa  44.7  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  28.1 
 
 		 475 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>