49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1940 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  100 
 
 
453 aa  837    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  35.21 
 
 
402 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.83 
 
 
501 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  28.47 
 
 
456 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  35 
 
 
465 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  31.76 
 
 
434 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  31.62 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.93 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.93 
 
 
457 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.14 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  33.86 
 
 
595 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  30.68 
 
 
498 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  30.17 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  30.17 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  26.56 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  29.21 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  27.08 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  27.37 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  30.4 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  26.48 
 
 
447 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  33.88 
 
 
496 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  34.02 
 
 
531 aa  47.8  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  30.91 
 
 
401 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  27.92 
 
 
388 aa  47  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  25.41 
 
 
404 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  25.41 
 
 
404 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  32.2 
 
 
607 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  25.41 
 
 
404 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  34.17 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  37.5 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  34.58 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0609  O-antigen polymerase  30.43 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  28.74 
 
 
672 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  29.49 
 
 
549 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  36.11 
 
 
512 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  28.11 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.62 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  30.08 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  34.71 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  29.34 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  31.01 
 
 
409 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  24.86 
 
 
404 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  29.51 
 
 
492 aa  44.3  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  27.37 
 
 
475 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  26.85 
 
 
464 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  31.43 
 
 
467 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  21.95 
 
 
495 aa  43.5  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  24.88 
 
 
443 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>