16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4808 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4936  O-antigen polymerase  98.72 
 
 		 391 aa  754    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  100 
 
 		 391 aa  761    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  90.54 
 
 		 391 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  29.68 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  30 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  32.01 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44730  O-antigen polymerase protein  26.32 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 413 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0534  hypothetical protein  27.2 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  39.68 
 
 		 605 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4986  hypothetical protein  27.34 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  36.99 
 
 		 582 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_002950  PG1051  hypothetical protein  24.62 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0129873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  38.57 
 
 		 531 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>