18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1418 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  100 
 
 		 397 aa  783    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  59.79 
 
 		 397 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  56.99 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  39.53 
 
 		 620 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  30.63 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4936  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  34.53 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  30.58 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44730  O-antigen polymerase protein  27.83 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  35.71 
 
 		 894 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0891  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4829  O-antigen polymerase  24.49 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.126045  hitchhiker  0.0000506097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  28.17 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  34.88 
 
 		 459 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0421  O-antigen polymerase  25 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  20.41 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1258  hypothetical protein  29.6 
 
 		 448 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.627245  normal  0.383211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>