11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3150 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  100 
 
 
388 aa  782    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4829  O-antigen polymerase  50 
 
 
389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.126045  hitchhiker  0.0000506097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  31.25 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  27.75 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  27.84 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  29.15 
 
 
620 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  27.54 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.23 
 
 
467 aa  47.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  30.58 
 
 
397 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.51 
 
 
464 aa  43.9  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  30.96 
 
 
479 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>