14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2800 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  100 
 
 		 422 aa  830    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  26.94 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  31.94 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  29.24 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3838  hypothetical protein  26.4 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.44323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4469  hypothetical protein  26.39 
 
 		 422 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  29.55 
 
 		 404 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1650  hypothetical protein  34.75 
 
 		 435 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  28.23 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>