9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0891 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0891  O-antigen polymerase  100 
 
 		 393 aa  789    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.335212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1764  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 560 aa  50.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1889  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 494 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818952  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  27.94 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  23.4 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  27.94 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  28.42 
 
 		 489 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  22.96 
 
 		 442 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>