11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44730 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_44730  O-antigen polymerase protein  100 
 
 		 419 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  25.74 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  27.82 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  24.81 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  26.53 
 
 		 620 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3838  hypothetical protein  30.29 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.44323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.12 
 
 		 781 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4936  O-antigen polymerase  25.46 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0601  hypothetical protein  25.98 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347333  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.59 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>