165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1548 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
305 aa  596  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  53.39 
 
 
280 aa  228  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  52.54 
 
 
274 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.92 
 
 
284 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.51 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  88.14 
 
 
514 aa  106  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  94.44 
 
 
514 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  94.44 
 
 
173 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  55.65 
 
 
336 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  90.74 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  92.59 
 
 
2200 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  90.74 
 
 
522 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  75 
 
 
121 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  90.91 
 
 
167 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  90.74 
 
 
394 aa  97.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  89.66 
 
 
172 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  90.74 
 
 
3275 aa  95.9  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  69.14 
 
 
112 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  92.59 
 
 
100 aa  95.5  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  90.74 
 
 
172 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  72.6 
 
 
105 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  90.74 
 
 
104 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  87.04 
 
 
385 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  88.89 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  59.14 
 
 
143 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  85.19 
 
 
192 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.83 
 
 
148 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  81.48 
 
 
582 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.8 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  26.46 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  26.46 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  45.83 
 
 
161 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  45.45 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  45.45 
 
 
478 aa  73.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  37.96 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  35.51 
 
 
132 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  29.08 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  35.51 
 
 
132 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  37.04 
 
 
132 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  37.04 
 
 
132 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  37.04 
 
 
132 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  34.13 
 
 
144 aa  60.1  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.96 
 
 
221 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  31.78 
 
 
144 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  68.75 
 
 
111 aa  59.7  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.97 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  31.86 
 
 
133 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  31.45 
 
 
144 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35.43 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  90.32 
 
 
125 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.04 
 
 
365 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  30.26 
 
 
210 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  32.32 
 
 
132 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  36.45 
 
 
141 aa  56.2  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  29.8 
 
 
139 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  29.8 
 
 
139 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  29.8 
 
 
139 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  29.8 
 
 
139 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 
146 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.4 
 
 
206 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  96.43 
 
 
209 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  87.1 
 
 
563 aa  55.8  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  30.26 
 
 
173 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
279 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  30.26 
 
 
173 aa  55.8  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.57 
 
 
165 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.78 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  29.32 
 
 
163 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.33 
 
 
126 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  73.68 
 
 
149 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  73.68 
 
 
98 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.5 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  73.68 
 
 
132 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  73.68 
 
 
156 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.38 
 
 
524 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  84.38 
 
 
156 aa  53.1  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  30.56 
 
 
162 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  73.68 
 
 
79 aa  53.1  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  73.68 
 
 
109 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  73.68 
 
 
135 aa  52.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  28.79 
 
 
143 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  31.01 
 
 
144 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  92.86 
 
 
97 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  73.68 
 
 
97 aa  52.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  27.94 
 
 
189 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  31.2 
 
 
125 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  27.94 
 
 
189 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  27.94 
 
 
189 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  27.94 
 
 
189 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  27.94 
 
 
189 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  29.41 
 
 
189 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  42.11 
 
 
135 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  92.31 
 
 
88 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  84.38 
 
 
99 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  29.52 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  75 
 
 
105 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 
181 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.89 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  32.26 
 
 
179 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  40.79 
 
 
135 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>