29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0249 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  100 
 
 
492 aa  968    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  30.15 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1889  O-antigen polymerase  30.95 
 
 
494 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.818952  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  27.69 
 
 
592 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  27.69 
 
 
592 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  27.69 
 
 
592 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  27.82 
 
 
595 aa  50.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  27 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  30 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.23 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  34.04 
 
 
408 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  37.96 
 
 
595 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  34.04 
 
 
408 aa  47  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  37.04 
 
 
595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  37.04 
 
 
595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  37.04 
 
 
595 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  37.04 
 
 
595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  37.04 
 
 
595 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  37.04 
 
 
661 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.77 
 
 
773 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  25.37 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
358 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  24.71 
 
 
594 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  27.27 
 
 
461 aa  43.9  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  25 
 
 
594 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  28.57 
 
 
404 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.27 
 
 
404 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  37.33 
 
 
735 aa  43.5  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>