40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02935 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  814    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  25.07 
 
 
410 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  23.88 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  25.76 
 
 
426 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  23.38 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  24.37 
 
 
426 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  23.38 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  23.51 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
595 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  27.1 
 
 
438 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
661 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  27.59 
 
 
426 aa  49.7  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
405 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  19.26 
 
 
595 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  27.59 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  24.29 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  24.29 
 
 
408 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  18.35 
 
 
595 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  33.33 
 
 
427 aa  47.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  27.5 
 
 
435 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  19.35 
 
 
438 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0602  lipid A core--O-antigen ligase  22.09 
 
 
416 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3912  O-antigen ligase  22.12 
 
 
404 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0464096 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  33.33 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  23.64 
 
 
426 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3993  O-antigen ligase  22.36 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4038  O-antigen ligase  22.04 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3931  O-antigen ligase  22.12 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  20.95 
 
 
594 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  21.62 
 
 
489 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  17.72 
 
 
592 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  27 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  17.72 
 
 
592 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4099  O-antigen ligase  22.04 
 
 
404 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  17.72 
 
 
592 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>