15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0515 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  37.2 
 
 
1065 aa  680    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  42.9 
 
 
1070 aa  823    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  100 
 
 
1090 aa  2202    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0120  O-antigen polymerase  36.92 
 
 
1065 aa  673    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  29.67 
 
 
874 aa  328  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.11 
 
 
773 aa  65.1  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  22.94 
 
 
829 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  27.36 
 
 
428 aa  56.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  23.95 
 
 
612 aa  55.5  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  32.95 
 
 
540 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  22.13 
 
 
454 aa  48.5  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  19.7 
 
 
607 aa  47.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  24.55 
 
 
440 aa  47  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  25.32 
 
 
686 aa  45.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  25.32 
 
 
686 aa  45.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>