32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0615 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  100 
 
 		 703 aa  1450    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  99.15 
 
 		 759 aa  1441    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 		 255 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 		 241 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 276 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 252 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 229 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  36.63 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.41 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  32.59 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  25.41 
 
 		 241 aa  57  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 255 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  32.08 
 
 		 252 aa  55.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  24.59 
 
 		 258 aa  54.3  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  27.06 
 
 		 260 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 		 239 aa  51.2  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 262 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  26.32 
 
 		 260 aa  48.5  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 236 aa  47.4  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 255 aa  47.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  28.39 
 
 		 294 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  40.62 
 
 		 253 aa  45.8  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  26.4 
 
 		 267 aa  45.8  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 279 aa  45.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 428 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  24.77 
 
 		 427 aa  44.3  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>