45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2398 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  100 
 
 		 260 aa  534  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  97.31 
 
 		 260 aa  521  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  33.96 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  28 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  27.44 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  30.7 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  25.79 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  26.91 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  29.13 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  22.9 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  26.84 
 
 		 759 aa  53.9  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  23.56 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  27.06 
 
 		 703 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  24.45 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  29.36 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 253 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  40.91 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  26.73 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1040  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 		 1122 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  26.73 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 593 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>