55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0111 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 252 aa  520  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  50.6 
 
 		 256 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  50.6 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  51.95 
 
 		 229 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  32.82 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  31 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  28.77 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  29.33 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  35.51 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  24.54 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  28.36 
 
 		 703 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  28.93 
 
 		 759 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  30.63 
 
 		 269 aa  67.8  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  25.84 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 236 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  25.4 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  32.22 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  22.33 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  32.98 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  25.84 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  26.13 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  34.74 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  32.63 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 250 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  29 
 
 		 241 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  23.73 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  22.62 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0745  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0144834  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.46 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  21.65 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  30.3 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3435  glycosyl transferase family 25  24.35 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  23.4 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6471  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 218 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160461  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25.68 
 
 		 254 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>