42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3896 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 236 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  36.36 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  31.89 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.08 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  30.56 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  30.8 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  26.96 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  22.97 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  27.98 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  24.3 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0745  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0144834  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  25.2 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  24.41 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  23.47 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  23.98 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 250 aa  48.9  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 253 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  24.1 
 
 		 759 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  24.62 
 
 		 703 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  27.59 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0791  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  29.67 
 
 		 265 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  21.61 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001816  LPS biosynthesis glycosyltransferase  21.55 
 
 		 253 aa  41.6  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00205752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>