51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4381 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  28.4 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  28 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  26.05 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  24.54 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  28.44 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.05 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  33 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1067  hypothetical protein  28.28 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0181133  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  30.39 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4166  glycosyl transferase family 25  21.26 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4193  glycosyl transferase family 25  21.26 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.365457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  24.41 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  22.02 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  22.54 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4050  glycosyl transferase family protein  21.08 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.08 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  22.9 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  25.48 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  21.05 
 
 		 252 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  24.57 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  26.23 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  27.37 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  21.15 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  26.14 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0791  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  30.77 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6471  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160461  normal  0.583924 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  23.4 
 
 		 759 aa  42.7  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  21.35 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  30.11 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>