39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2116 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  48.52 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  48.52 
 
 
239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  49.57 
 
 
255 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
239 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
229 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  25 
 
 
252 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  37.39 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  44.12 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  34.51 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  25.45 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  27.41 
 
 
253 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  27.78 
 
 
231 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
318 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  33.64 
 
 
275 aa  48.9  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  26.03 
 
 
254 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
255 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  25.11 
 
 
251 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
260 aa  47  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
260 aa  46.6  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  35.11 
 
 
260 aa  46.6  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  30.97 
 
 
253 aa  45.4  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.34 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  30.77 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  31.4 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  26.21 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  24.24 
 
 
241 aa  43.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
272 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
250 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>