31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2251a on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  80.08 
 
 
275 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 
272 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  29.61 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  44.12 
 
 
250 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  34.41 
 
 
241 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  26.61 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  24.24 
 
 
297 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 
256 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
254 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 
255 aa  50.8  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 
262 aa  48.5  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  23.2 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  32.96 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
318 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  35.09 
 
 
253 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  25.76 
 
 
249 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  40.91 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  40.91 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3318  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
258 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
258 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>