48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2114 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  35.56 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  33.18 
 
 
269 aa  106  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
255 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
250 aa  92.4  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  35.71 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  31.29 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  31.29 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  23.86 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  35.03 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  27.67 
 
 
252 aa  58.9  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  34.38 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  24.59 
 
 
703 aa  54.3  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  24.9 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  30.12 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  24.74 
 
 
759 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  27.51 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
239 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  25.91 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  28.31 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  21.67 
 
 
297 aa  50.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  37.08 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
253 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3318  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
258 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001816  LPS biosynthesis glycosyltransferase  24.75 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00205752  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  24.86 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  25.14 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>