43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1207 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
255 aa  532  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  56.47 
 
 
255 aa  327  9e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  37.45 
 
 
247 aa  160  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1547  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
260 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1605  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  26.52 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  28.39 
 
 
253 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0637  lipooligosaccharide biosynthesis protein  48.53 
 
 
158 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.124719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04234  glycosyltransferase  21.69 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  21.2 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
318 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2398  glycosyl transferase family 25  24.7 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.498272  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  25 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0824  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.635331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  26.52 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2003  glycosyl transferase family 25  30.19 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653042  normal  0.556653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4381  glycosyl transferase family 25  27.45 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0643142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  24.88 
 
 
254 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
239 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  21.47 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  31.91 
 
 
275 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
272 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  23.77 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
229 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  24.63 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  23.17 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3344  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.297901  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
241 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3129  glycosyl transferase  26.19 
 
 
275 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0745  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0144834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 
253 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  26.8 
 
 
759 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  25 
 
 
265 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>