44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0728 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0728  LPS biosynthesis glycosyltransferase  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3773  glycosyl transferase family 25  33.67 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0205  glycosyl transferase family 25  32.32 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3896  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1207  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.539857  hitchhiker  0.00960164 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0987  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.272877  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0207  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.757626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0608  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0986  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000136423 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2231  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0445288  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 759 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.865604  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0075  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.3559 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00665  glycosyl transferase  29.35 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3927  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512494  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2757  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0615  hypothetical protein  32.59 
 
 		 703 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.370403  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3513  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.217336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0111  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2760  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0415  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0765  glycosyl transferase family 25  33.69 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2114  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.953679  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3698  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 272 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2116  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.87908  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0249  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0819966  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1165  LPS glycosyltransferase subfamily protein  22.73 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0702  glycosyl transferase family 25  28.42 
 
 		 294 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161368  normal  0.881602 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0638  Lob1 protein  23.9 
 
 		 297 aa  49.7  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0351938  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3318  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1218  putative glycosyltransferase involved in LPS biosynthesis  32.03 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3775  glycosyl transferase family 25  43.75 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0116  glycosyl transferase family protein  22.7 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0321  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0457  ExsB  29.51 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.15278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0337  glycosyl transferase family protein  22.64 
 
 		 239 aa  47.4  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.435264  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1284  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  24.29 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0609712  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0378  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166362  normal  0.0272961 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1375  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2251a  hypothetical protein  35.09 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1934  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236002  normal  0.0365788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6017  glycosyl transferase family 25  31.58 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.307747 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0581  putative lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  23.08 
 
 		 254 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.513876  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3041  putative glycosyltransferase  34.25 
 
 		 231 aa  42.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.215334  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1040  glycosyl transferase family 2  21.34 
 
 		 1122 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>